Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
独居于海边小镇的女高中生比名子，因为小时候家人遭遇事故丧命，自己也有了寻死的念头。一天、一位名叫汐莉的吃人人鱼出现在她面前……。2人的相遇究竟是会带来「破灭」还是「救赎」呢……。
然而───这群人的真实身份，是与企图毁灭世界的神秘灾难抗争的英雄。通过现场演出 让人们为之狂热，并集结这份力量而战。但由于表面上看起来只是演出，世人并不知道这群人是英雄。
爸爸是英雄，妈妈是精灵王，艾莲拥有专属于科学家的独特技能——根据自己的喜好来改变物质的结构与合成。在爸爸、妈妈与精灵们的宠爱下，艾莲幸福成长，却在和爸爸造访人间之际被国王盯上，全家人陷入危机？人类和精灵200百年前的纠葛重新被提起，两族似乎永远无法重归于好……诅咒再一次降临人界，无数无辜人民受害。精灵艾莲决定，运用知识和力量，守护人类也守护家人。
